El Departamento de Apoyo a la Investigación adscrito a la Dirección General de Investigación y Posgrado, realiza diversos servicios de apoyo a la comunidad de investigadores de la Universidad Autónoma de Aguascalientes. Tales, como la coordinación del proceso de evaluación, gestión de recursos y seguimiento de avances de Proyectos de Investigación, así como apoyo en la gestión de las formas de proteger la propiedad intelectual, difusión y apoyo en convocatorias para la obtención de fondos externos. Apoyos en las gestiones ante instituciones como el Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACYT), el Sistema Nacional de Investigadores (SNI), Fondos Mixtos, la Academia Mexicana de las Ciencias (AMC), el Programa para el Desarrollo Profesional Docente para el Tipo Superior (PRODEP), el Instituto Mexicano de la Propiedad Industrial (IMPI), entre otras.

Adicionalmente el Departamento promociona y difunde el quehacer científico universitario a través de la publicación de la revista Investigación y Ciencia de la Universidad Autónoma de Aguascalientes, organización de eventos de investigación. Promueve el interés por la ciencia y la tecnología en niños, jóvenes y público en general a través de diferentes programas de divulgación científica.