La Secretaría General tiene como objetivo llevar el control y avance académico de los alumnos, el control de ingreso y permanencia, promoción y terminación de las relaciones de trabajo del personal de la Universidad, la conformación de una fuente de información de archivos históricos y documentales de esta Universidad, así como todos aquellos que se deriven del H. Consejo Universitario y las que acuerde el Sr. Rector.

Actualmente Secretaría esta compuesto por los siguientes departamentos: Archivo General, Control Escolar, Jurídico y Recursos Humanos.